下記の環境で2台のiPhoneを使っています
M1 Mac mini Sonoma 14.3.1
iPhone15 pro 17.3.1 →同期できず （ Apple watch 使用、やっぱりwatchの問題なのでしょうね。）
iPhone13 mini 17.3.1 →同期OK （watchは接続していません）
(毎日ラジオ録音の語学番組をiPhoneに入れているので、同期できるiPhone13 miniだけで何とかしていました。)

続報です。
いつも、2/4で止まり、30秒くらい待ち、だめだ＝再発してると考えていたのですが、
本日ずーーーーーっと待っていたら、５分くらいして、同期しました。
なので、同期できないでなくて、同期にすごーーーーーく時間がかかるが事象かもしれません。
時間あるときに、何回か試してみます。

apple watchのcrshreportをappleに送信しようとしてできず、
タイムアウトして、うまくいった、みたいな感じですかね。

sonoma 14.3.1と、iOS/watchOSを対応する最新にupdateしましたが、
私の環境では不具合なおりません。
不具合というのは、
　ステップ2/4から同期がすすまない
　activity monitorでMDcrashreporttoolをkillすると進行・完了する
　apple watchのペアリングを解除すると再発しない
です。

17.4待ちます・・・

実験したところ、AppleWatchとの通信を切れば同期が完了する傾向というのが分かり、どうも同期ができない問題の根本はAppleWatchにあるかもしれませんね。

具体的にはWi-Fiとbluetoothをそれぞれオフにしてから同期したところ、正常に終了することが多くなりました。

当方の環境は　iPhone13 iOS17.3でAppleWatch７です。

参考になれば幸いです。

使用環境
iPhone15Pro(iOS17.3)とMacBook Pro(14-inch,M3,Sonoma 14.3)

ただ5分以上待つと同期が完了します。
以前は1分かからず(30秒程)で完了していました。

毎回アクティビティモニタやコマンド打つのが面倒なので
Windowsでいう所のBATファイルを作り、Finderのツールバーに置いてます。
Macでは同期はiTunesは使用しないのでFinderから同期をクリック後
ツールバーのアイコンをクリックするとすぐ同期が完了します。

ファイルの中身(拡張子を.commandで保存)

#!/bin/bash
#KillMDCrashReportTool

killall -9 MDCrashReportTool

killall Terminal

一瞬黒いターミナル画面が出ますがすく消えターミナル自身も終了します。
ご参考にどうぞ

MacOS Sonoma14.3とiOS１７.３で試してみました。
MDCCrashReportToolは立ち上がりますが、同期は問題なく出来るようになりました。
ただMDCCrashReportToolは強制終了しないとそのままメモリに残ってしまいます。

私もAppleWatchを使っているので、ｚｚｚさんの情報通りやってみました。
AppleWatchとのペアリング解除を行うと、同期１回目はMDCCrashReportToolが一瞬立ち上がりすぐに消えます。2回目同期以降はMDCCrashReportToolは立ち上がらなくなりました。
再びAppleWatchをペアリングするとまた元に戻ってしまいMDCCrashReportToolのプロセス（４.９MB程度）が立ち上がったまま残ってしまいます。
これはAppleWatchペアリングが原因かもしれませんね。

放っておいても同期できるようにはなりましたが、MDCCrashReportToolの問題はまだFixとは行かないようです。